死神流克将死亡笔记遗失后，被13岁中先生镜太郎捡到，将其当作日记本运用。在有意间将5个欺负过他的同窗杀死，而置信笔记是真的。惊慌的镜太郎应用流克给予的死亡橡皮擦擦去笔记上的名字，使得5人复生。调查此事的2名警察在得知5人复生后，赶到学校调查讯问，但却同复生的5人一同被人杀死。镜太郎讯问流克，发现流克的另一本笔记丧失，而联想到异样被那5人欺负和被警察讯问过的三浦。最初，镜太郎找到三浦，运用橡皮擦擦掉已死7人的名字，然后把第二本笔记交给复生的2名警察。在警察面前，镜太郎让三浦杀死本人作为实验，然后用橡皮擦擦掉名字复生，令警察置信。然后，四人将笔记烧毁，并且不断保守机密。7年后，镜太郎长大成人，一直保管着第一本笔记，并将死亡笔记的故事作为小说宣布。